Wikiに書いている計算式では必ず1~100ほどダメージがずれるので
ダメージ計算方法を試行錯誤した結果以下の式で100%一致しました
「ceil(ceil(表示攻撃力 / 10) / 防御固有値 * 装備倍率 * 乱数)」

ここでの100%一致とは、乱数が0.1%刻みという前提で
ベース攻撃力(ceil(表示攻撃力 / 10) / 防御固有値 * 装備倍率)に実測ダメージと最も近くなる乱数倍率を掛け
小数点を切り上げた値が記録した実測データ全てと一致した事を指します
取りうる全てのデータを記録しているわけではないため、間違えを含む可能性はありますが
いくつものサンプルで一致しているため、その点に関しては無視するものとします(計測にかかる時間が倍以上になるため)

手動で計算すると時間がかかるので自作ツールで確認しています
(単純に実測ダメージと攻撃力を割って倍率を求め、攻撃力に倍率を掛けているだけです)
http://gbf.xzz.jp/damage.html
※5/27 2:35 切り捨てと切り上のラベルが逆になっていたのを修正しました
元々は実測値と防御固有値を入力し、理論攻撃力を求めるために作った物ですが
現在は全ての実測値が一致するかの確認用に使っています

最後に、表示攻撃力が基準に計算されているかを調べました
表示攻撃力は四捨五入で計算されているため切り上(0.5~1.0の間)、切り捨て(0.0~0.5の間)の2パターンチェックしました
武器による倍率は一律で1.67 * 2.8 * 1.15 * 2.05です

  • 40290.149999999994の場合(切り捨で表示攻撃力40290)、4029、4030どちらで計算されているか
    • 実測値 43260 43038 42683 44948 46014 43038 45037 46502 43749 44148 42505
    • 結果 4029 * 1.67 * 2.8 * 1.15 * 2.05で一致したため4029で計算されていました(4030は一致する倍率0個)
  • 40600.899999999994の場合(切り上で表示攻撃力40601)、4060、4061どちらで計算されているか
    40290.149999999994の結果により小数点以下は無視されているためおそらく表示攻撃力基準と思われます
    そのため、小数点を無視しているだけなら4060、表示攻撃力が基準なら4061で計算されることになります

    • 実測値 46021 46827 45439 45215 45260 42887 46737 46827 46603 46424 43738 42887 44768
    • 結果 4061 * 1.67 * 2.8 * 1.15 * 2.05で一致したため4061で計算されていました(4060は一致する倍率0個)

以上の結果により、表示攻撃力が基準で計算されていると推測されます

記事タイトルが消えていたため2016/5/28に修正しました 
装備データにムーン交換装備データを追加しました
暴君やレッドサンのUnkownスキル等の現段階で自動設定されないスキルの対応については検討中です
4凸で追加されるスキルや変更されるスキルについては段階が予測不可能であるため、自動設定予定はありません

1040007500 エクスカリバー 50 紅蓮の堅守 王道を征く者 41 244 475 2848
1040007600 エクスカリバー 50 霧氷の堅守 王道を征く者 41 244 475 2848
1040007700 エクスカリバー 50 地裂の堅守 王道を征く者 41 244 475 2848
1040007800 エクスカリバー 50 乱気の堅守 王道を征く者 41 244 475 2848
1040002000 エクスカリバー 50 天光の堅守 王道を征く者 41 244 475 2848
1040007900 エクスカリバー 50 奈落の堅守 王道を征く者 41 244 475 2848
1040200900 ゲイボルグ 50 必勝の誓い 一刺一殺 45 289 454 2624
1040205500 ゲイボルグ 50 必勝の誓い 一刺一殺 45 289 454 2624
1040205600 ゲイボルグ 50 必勝の誓い 一刺一殺 45 289 454 2624
1040205700 ゲイボルグ 50 必勝の誓い 一刺一殺 45 289 454 2624
1040205800 ゲイボルグ 50 必勝の誓い 一刺一殺 45 289 454 2624
1040205900 ゲイボルグ 50 必勝の誓い 一刺一殺 45 289 454 2624
1040106600 ダマスカスナイフ 短剣 50 仄暗い稼業 引き際の心得 41 267 472 2732
1040106800 ダマスカスナイフ 短剣 50 仄暗い稼業 引き際の心得 41 267 472 2732
1040106900 ダマスカスナイフ 短剣 50 仄暗い稼業 引き際の心得 41 267 472 2732
1040107000 ダマスカスナイフ 短剣 50 仄暗い稼業 引き際の心得 41 267 472 2732
1040107100 ダマスカスナイフ 短剣 50 仄暗い稼業 引き際の心得 41 267 472 2732
1040107200 ダマスカスナイフ 短剣 50 仄暗い稼業 引き際の心得 41 267 472 2732
1040406900 カドゥケウス 50 火の神威 窮地の救い手 54 325 407 2441
1040407100 カドゥケウス 50 水の神威 窮地の救い手 54 325 407 2441
1040407200 カドゥケウス 50 土の神威 窮地の救い手 54 325 407 2441
1040407300 カドゥケウス 50 風の神威 窮地の救い手 54 325 407 2441
1040407400 カドゥケウス 50 光の神威 窮地の救い手 54 325 407 2441
1040407500 カドゥケウス 50 闇の神威 窮地の救い手 54 325 407 2441
1040304400 ミョルニル 50 紅蓮の攻刃 戦神の打擲 36 217 497 2983
1040304500 ミョルニル 50 霧氷の攻刃 戦神の打擲 36 217 497 2983
1040304600 ミョルニル 50 地裂の攻刃 戦神の打擲 36 217 497 2983
1040304700 ミョルニル 50 乱気の攻刃 戦神の打擲 36 217 497 2983
1040300100 ミョルニル 50 天光の攻刃 戦神の打擲 36 217 497 2983
1040304800 ミョルニル 50 奈落の攻刃 戦神の打擲 36 217 497 2983
1040504400 フライクーゲル 50 紅蓮の暴君 好機到来 34 203 509 3051
1040504600 フライクーゲル 50 霧氷の暴君 好機到来 34 203 509 3051
1040504700 フライクーゲル 50 地裂の暴君 好機到来 34 203 509 3051
1040504800 フライクーゲル 50 乱気の暴君 好機到来 34 203 509 3051
1040504900 フライクーゲル 50 天光の暴君 好機到来 34 203 509 3051
1040505000 フライクーゲル 50 奈落の暴君 好機到来 34 203 509 3051
1040604200 方天画戟 格闘 50 剛技の代償 万物を砕く剛技 43 278 463 2678
1040604500 方天画戟 格闘 50 剛技の代償 万物を砕く剛技 43 278 463 2678
1040604600 方天画戟 格闘 50 剛技の代償 万物を砕く剛技 43 278 463 2678
1040604700 方天画戟 格闘 50 剛技の代償 万物を砕く剛技 43 278 463 2678
1040604800 方天画戟 格闘 50 剛技の代償 万物を砕く剛技 43 278 463 2678
1040604900 方天画戟 格闘 50 剛技の代償 万物を砕く剛技 43 278 463 2678
1040703600 ヘラクレス 50 業火の克己 不死をも殺す神弓 39 255 492 2854
1040703800 ヘラクレス 50 渦潮の克己 不死をも殺す神弓 39 255 492 2854
1040703900 ヘラクレス 50 大地の克己 不死をも殺す神弓 39 255 492 2854
1040704000 ヘラクレス 50 竜巻の克己 不死をも殺す神弓 39 255 492 2854
1040704100 ヘラクレス 50 雷電の克己 不死をも殺す神弓 39 255 492 2854
1040704200 ヘラクレス 50 憎悪の克己 不死をも殺す神弓 39 255 492 2854
1040803700 ウルリクムミ 楽器 50 紅蓮の括目 流行詩歌 76 271 438 2529
1040803900 ウルリクムミ 楽器 50 霧氷の括目 流行詩歌 76 271 438 2529
1040804000 ウルリクムミ 楽器 50 地裂の括目 流行詩歌 76 271 438 2529
1040804100 ウルリクムミ 楽器 50 乱気の括目 流行詩歌 76 271 438 2529
1040804200 ウルリクムミ 楽器 50 天光の括目 流行詩歌 76 271 438 2529
1040804300 ウルリクムミ 楽器 50 奈落の括目 流行詩歌 76 271 438 2529
1040904300 天羽々斬 50 業火の刹那 戮蛇の神刀 37 213 504 3024
1040904500 天羽々斬 50 渦潮の刹那 戮蛇の神刀 37 213 504 3024
1040904600 天羽々斬 50 大地の刹那 戮蛇の神刀 37 213 504 3024
1040904700 天羽々斬 50 竜巻の刹那 戮蛇の神刀 37 213 504 3024
1040904800 天羽々斬 50 雷電の刹那 戮蛇の神刀 37 213 504 3024
1040904900 天羽々斬 50 憎悪の刹那 戮蛇の神刀 37 213 504 3024

 

思っていたより反響がよかったので可能な限りマスターピース周りの武器データを収集して追加しました
ウコンバサラ、ケーリュケイオンの情報がWiki上で取得した段階で???になっていたので最新版に修正しました

1040003500 スコフニュング 50 不屈なる忠義 救世の聖剣 35 207 377 2385
1040005100 スコフニュング・リビルド 55 不屈なる忠義 救世の聖剣 35 209 377 2405
1040005200 スコフニュング・ウヌ 60 不屈なる忠義 救世の聖剣 35 244 377 2810
1040005300 スコフニュング・ドゥ 60 不屈なる忠義 救世の聖剣 35 244 377 2810
1040005400 スコフニュング・トリ 60 不屈なる忠義 救世の聖剣 35 244 377 2810
1040005500 スコフニュング・クヴァール 60 不屈なる忠義 救世の聖剣 35 244 377 2810
1040005600 スコフニュング・クヴィン 60 不屈なる忠義 救世の聖剣 35 244 377 2810
1040005700 スコフニュング・セス 60 不屈なる忠義 救世の聖剣 35 244 377 2810
1040402800 ニルヴァーナ 50 悟りの境地 輪廻転生 44 274 332 2053
1040404500 ニルヴァーナ・リビルド 55 悟りの境地 輪廻転生 44 276 332 2070
1040404600 ニルヴァーナ・ウヌ 60 悟りの境地 輪廻転生 44 322 332 2420
1040404700 ニルヴァーナ・ドゥ 60 悟りの境地 輪廻転生 44 322 332 2420
1040404800 ニルヴァーナ・トリ 60 悟りの境地 輪廻転生 44 322 332 2420
1040404900 ニルヴァーナ・クヴァール 60 悟りの境地 輪廻転生 44 322 332 2420
1040405000 ニルヴァーナ・クヴィン 60 悟りの境地 輪廻転生 44 322 332 2420
1040405100 ニルヴァーナ・セス 60 悟りの境地 輪廻転生 44 322 332 2420
1040103000 ファウスト 短剣 50 森羅万象の理 禁忌の錬成 38 229 364 2276
1040104700 ファウスト・リビルド 短剣 55 森羅万象の理 禁忌の錬成 38 231 364 2295
1040104800 ファウスト・ウヌ 短剣 60 森羅万象の理 禁忌の錬成 38 270 364 2680
1040104900 ファウスト・ドゥ 短剣 60 森羅万象の理 禁忌の錬成 38 270 364 2680
1040105000 ファウスト・トリ 短剣 60 森羅万象の理 禁忌の錬成 38 270 364 2680
1040105100 ファウスト・クヴァール 短剣 60 森羅万象の理 禁忌の錬成 38 270 364 2680
1040105200 ファウスト・クヴィン 短剣 60 森羅万象の理 禁忌の錬成 38 270 364 2680
1040105300 ファウスト・セス 短剣 60 森羅万象の理 禁忌の錬成 38 270 364 2680
1040006200 アシュケロン 50 征伐の剣 深紅の支配者 31 203 397 2405
1040006300 アシュケロン・リビルド 55 征伐の剣 深紅の支配者 31 205 397 2425
1040006400 アシュケロン・ウヌ 60 征伐の剣 深紅の支配者 31 240 397 2830
1040006500 アシュケロン・ドゥ 60 征伐の剣 深紅の支配者 31 240 397 2830
1040006600 アシュケロン・トリ 60 征伐の剣 深紅の支配者 31 240 397 2830
1040006700 アシュケロン・クヴァール 60 征伐の剣 深紅の支配者 31 240 397 2830
1040006800 アシュケロン・クヴィン 60 征伐の剣 深紅の支配者 31 240 397 2830
1040006900 アシュケロン・セス 60 征伐の剣 深紅の支配者 31 240 397 2830
1040503500 ネブカドネザル 50 繚乱の死神 穢れなき手向け 24 167 435 2585
1040503600 ネブカドネザル・リビルド 55 繚乱の死神 穢れなき手向け 24 169 435 2605
1040503700 ネブカドネザル・ウヌ 60 繚乱の死神 穢れなき手向け 24 200 435 3040
1040503800 ネブカドネザル・ドゥ 60 繚乱の死神 穢れなき手向け 24 200 435 3040
1040503900 ネブカドネザル・トリ 60 繚乱の死神 穢れなき手向け 24 200 435 3040
1040504000 ネブカドネザル・クヴァール 60 繚乱の死神 穢れなき手向け 24 200 435 3040
1040504100 ネブカドネザル・クヴィン 60 繚乱の死神 穢れなき手向け 24 200 435 3040
1040504200 ネブカドネザル・セス 60 繚乱の死神 穢れなき手向け 24 200 435 3040

装備シミュレータに各種オリバーデータを追加しました

ID 名称 属性 種類 Rank スキル1 スキル2 MIN HP MAX HP MIN ATK MAX ATK
1040501600 オリバー 50 謀略と策謀の知恵 一攫千金 27 170 420 2571
1040502700 オリバー・リビルド 50 謀略と策謀の知恵 一攫千金 27 171 420 2595
1040502800 オリバー・ウヌ 50 謀略と策謀の知恵 一攫千金 27 200 420 3030
1040502900 オリバー・ドゥ 50 謀略と策謀の知恵 一攫千金 27 200 420 3030
1040503000 オリバー・トリ 50 謀略と策謀の知恵 一攫千金 27 200 420 3030
1040503100 オリバー・クヴァール 50 謀略と策謀の知恵 一攫千金 27 200 420 3030
1040503200 オリバー・クヴィン 50 謀略と策謀の知恵 一攫千金 27 200 420 3030
1040503300 オリバー・セス 50 謀略と策謀の知恵 一攫千金 27 200 420 3030

魔装機兵「神威」 土 マニアック

  • 1戦目
    • Lv30 降魔 HP726,000
    • Lv30 降魔 HP726,000
  • 2戦目
    • Lv30 降魔 HP1,089,000
    • Lv30 降魔 HP1,089,000
  • 3戦目
    • Lv75 魔装機兵「神威」 HP8,800,000

魔装機兵「神威」 闇 マニアック

  • 1戦目
    • Lv30 降魔 HP594,000
    • Lv30 降魔 HP594,000
  • 2戦目
    • Lv30 降魔 HP891,000
    • Lv30 降魔 HP891,000
  • 3戦目
    • Lv75 魔装機兵「神威」 HP7,200,000

魔装機兵「神威」 火 マニアック

  • 1戦目
    • Lv30 降魔 HP660,000
    • Lv30 降魔 HP660,000
  • 2戦目
    • Lv30 降魔 HP990,000
    • Lv30 降魔 HP990,000
  • 3戦目
    • Lv75 魔装機兵「神威」 HP8,000,000

レッド・サンはUnk大なのか確認
火補正武器は刀SLv1のみの状態でセレストハードを叩く
フロンティア号補正:6%
倍率計算
7%の場合42267.0972
6%の場合41872.0776
5%の場合41477.058

41885で実測ダメージと一致
6%だと推測されます

ダメージメモ レッド・サン

表示攻撃力が切り上、四捨五入、切り捨てなのかを再確認

環境

小数点の余地が入らないように以下の条件で検証します

  • マスターボーナス無し
  • 召喚石プロトバハムートLv1のみ
    Lv増加による小数点の余地を無くす
  • ジョブはプリースト
    攻撃補正がなければ何でも良い

素の表示攻撃力は
160 (召喚石)
+ 2800 (Rank45補正)
+ 72 (何故か素手で60、得意武器補正で72)
=3032

実験1

宿樹の仙杖Lv1 攻撃力178
得意武器補正178 * 1.2 = 213.6

表示攻撃力3174
160 (召喚石)
+ 2800 (Rank45補正)
+ 213.6
= 3173.6

小数点切り上

実験2

朽ち果てた杖Lv1 攻撃力1
得意武器補正1 * 1.2 = 1.2

表示攻撃力2961
160 (召喚石)
+ 2800 (Rank45補正)
+ 1.2
= 2961.2

小数点切り捨て
四捨五入だとわかります

実験3

ミスリルロッドLv2 攻撃力127 (127.6から切り捨て)
攻撃力計算は、ミスリルロッドの攻撃力が105 – 670である事から、
105 + (670 – 105) / 50 * 2 = 127.6
得意武器補正127 * 1.2 = 152.4 (127.6 * 1.2 = 153.12)

表示攻撃力3112
2960 + 152.4 = 3112.4
武器は小数点以下を切り捨てた状態で計算される

結果

表示攻撃力の小数点以下は四捨五入
武器Lvによる攻撃力の小数点以下は切り捨て
武器Lvによる攻撃力の小数点以下は切り捨てた状態で計算される

攻撃アップ無しでリバハード3回戦データ

データ1

表示攻撃力37449
実測攻撃力

  • 切り上 37459.9 (+10)
  • 四捨五入 37454.9 (+5)
  • 切り捨て 37449.9 (+0)

データ
3914
3787
3854
3877
3742
3596
3764
3854
3686
3922
3731
3659
3745
3869
3895
3854

データ2

表示攻撃力37088
実測攻撃力

  • 切り上 37100 (+12)
  • 四捨五入 37095 (+7)
  • 切り捨て 37090 (+2)

データ
3888
3817
3873
3839
3795
3695
3795
3620
3795
3543
3891
3735
3888
3695
3617
3880

データ3

表示攻撃力37458
実測攻撃力

  • 切り上 37470 (+12)
  • 四捨五入 37465 (+7)
  • 切り捨て 37460 (+2)

データ

3619
3866
3683
3806
3769
3878
3788
3743
3702
3934
3885
3870
3866
3705
3574
3627
3863
3926
3690

昨日誤差が不規則だったのでもう少し調べる
他の属性だとどうなのか調べた結果

ティアマトハード

表示攻撃力36006
総合攻撃力273245
光属性で検証
誤差+34

ダメージメモ10

関係なく誤差が出る
そこで攻刃無しで実験を試す

リバハード

表示攻撃力37449
攻刃0 属性0
誤差+5.9

ダメージメモ11

必ず0~100程度の誤差が出る…
0.001から0.0001に拡大してもそこまで変化がないので現状わからないです
打開するアイデアが出るまで温めておきましょう

2016/5/9 20:11、ユグハードデータ加筆、それに伴いデータ8修正

暴君のデータが欲しくてダメージを計算したものの若干のズレが有り
Wikiやらを調べてもわからないのでひたすらデータを取ることにしました
表計算で手動で倍率探すのは面倒なので半自動化、攻撃力を手動入力することで一致するかを判定する形になります
データはデバフなしのバフはソング・オブ・グランデのみで、ひたすら叩いています

データ1(リバハード)

総合攻撃力409305
サポ石40バハ
409366、409367で一致
+61
ダメージメモ1

データ2(リバハード)

総合攻撃力409305
サポ石40バハ
409366で一致(409367では一致しない数値が発生)
+61
ダメージメモ2

データ3(リバハード)

総合攻撃力409305
サポ石40バハ+1
409365で一致
+60
ダメージメモ3

Wikiでは切り捨てと書いていたので、ベース×倍率をroundから切り捨てに変更したものの、数値が変化しただけで同様の結果になりました
ただ、誤差は1なので攻撃力を小数点以下まで含めると全て一致すると推測されます。

データ4(セレストハード)

総合攻撃力409305
サポ石Rank62 40バハ
409366でのみ一致
+61
ダメージメモ4

データ5(セレストハード)

総合攻撃力409305
サポ石Rank58 37バハ+1
409365でのみ一致
ダメージメモ5

データ6(セレストハード)

総合攻撃力409305
サポ石Rank133 60バハ
409366でのみ一致
ダメージデータ6

やはりサポ石とサポ主は関係ないようですが、+61とは何なのでしょうか
39478 +29
39489 +16
39495 +61

データ7(コロッサスハード)

総合攻撃力409305
409366-409369で一致
+61
ダメージデータ8

データ8(コロッサスハード)

武器に+1付与
総合攻撃力409364
409364-409367で一致
409367.5-409367.7(次のユグハードデータより)
+3.5

ダメージデータ8

データ9(ユグハード)

総合攻撃力409364
409367.5-409367.7で一致
ダメージデータ9

まとめ

表示攻撃力 39478 39489 39495 39500
推定攻撃力 409130 409247 409305 409364
実測攻撃力 409159 409263 409366 409367.5
誤差 +29 +16 +61 +3.5